ESTRUTURAO movimento apaeano tem quatro níveis de atuação: 1-APAE do Município: são os pais e amigos que atuam no município em que a entidade se localiza, assegurando os direitos das pessoas com deficiência. 2-Coordenadoria Regional: todas as microrregiões do Brasil estão organizadas em delegacias regionais. A comunidade apaeana de cada região deve ter a programação dos eventos da sua localidade. O Conselheiro Regional é eleito pelas APAEs da microrregião. 3-Federação das APAEs do Estado: as APAEs estão organizadas em Federações em cada Estado. Estas entidades são responsáveis pelo trabalho de realização dos direitos das pessoas com deficiências em âmbito estadual; pelos contatos com determinados órgãos Estaduais e pela promoção de eventos como Olimpíadas, Festivais e Congressos. Cada Conselheiro Regional é eleito pelas APAEs e faz parte do Conselho de Administração. 4-Federação Nacional das APAEs: é a entidade responsável pelo direcionamento das atividades do movimento no contexto Nacional e lidera a luta pelos direitos dos cidadãos com deficiência no País. Para tanto, estabelece contatos com os órgãos competentes e promove eventos nacionais necessários ao desenvolvimento das atividades da área.
